Emmanuelle Huynh wurde als Tochter eines vietnamesischen Vaters und einer französischen Mutter geboren. Nach ihrem Philosophie-Studium und einer Tanzausbildung von 1984 - 1986 in der Mudra Schule, die von Maurice Béjart begründet wurde, arbeitete sie als Tänzerin in Projekten von Hervé Robbe und Odile Duboc.
1994 erarbeitete sie in Vietnam, ihrem Heimatland, das Stück "Mùa". seit 2004 ist Emmanuelle Huynh die Direktorin des Centre national de la danse contemporaine (CNDC) d'Angers.